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Das Gehäuse ist sicher nicht heißer als der Prozessor, da sind wohl die Namen vertauscht.
Wenn, dann hat der Prozzi 58° und das Mainboard 48°, was bei einem schlechten bzw. schlecht montierten (keine WL-Paste, sondern Pad) Prozessorkühler nichts so ungewöhnliches ist - ist auch halbsowild, mir würd´s zwar ned taugen, aber wurscht.
Ungewöhnlich ist eher die Mobotemp von 48, das ist schon sehr hoch - meine ist immer bei 30. Gehäuselüfter, 2 Stück, direkt ans NT hängen, sollten helfen.
Ansonsten kann es auch nicht sein, daß Deine Festplatten durch das Mainboard heißer werden, außer Du übertaktest.
Die Wärmequellen im Rechner sind: Prozessor, Festplatten, Grafikkarten. Wenn Du für gute Durchlüftung sorgst, wird das schon passen (unten reinsaugen, oben rausblasen).