Den Grund hat Who-T schon erwähnt. Die Files liegen in diesen Verzeichnissen, da die IDE´s die Java Programme in diesen Verzeichnissen ausführen. Rufst du die Programme von der Komandozeile auf, so werden die Dateien auch direkt in den jeweiligen Ordner erzeugt.
Alternativ schaue mal, ob du nicht das Verzeichnis in der IDE ändern kannst.
Und die 3. Möglichkeit ist die, dass Du getrennt ein Resourcenverzeichnis anlegst und den Pfad dahin absolut angibst.
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Was ist klein, grün und dreieckig?
Ein kleines grünes Dreieck!
Bahnübergänge sind die härtesten Drogen der Welt! Ein Zug und du bist weg!
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