Bei X-Setup kannst du vielerlei Einstellungen durchführen, eine Möglichkeit zum "Reinigen" der Registry hat das Programm (noch) nicht.
RegClean von MS, zu finden unter
http://www.createwindow.com/wininfo/regclean.htm
Power Tools, bzw. der Regcleaner darunter, zu finden unter
http://www.vtoy.fi/jv16/index.php
bzw. Tune UP
http://www.tuneup.de/
sind meine Helfer beim Reinigen der Registry
versuchen würde ich es schon noch, bevor ich WinME darüberinstalliere