Hi,
ich würde den unfreien

aber kostenlosen Bootloader boot-us in den MBR der Windowsplatte schreiben und LILO/Grub in den MBR der Linuxplatte.
Wenn Dir boot-us nicht gefällt kannst Du ihn leicht deinstallieren und Linux kannst Du auch noch immer per Diskette starten.
Gruß
santi