hi!
1) Knoppix kann AFAIK LVM. Das wäre IMHO die schnellste Möglichkeit.
2) Neu aufsetzen und das Logical Volume wieder einbinden sollte klappen. Du willst dich nur nicht mit den Parametern vertun

Ev. vorher eine Sicherung der Platte ziehen?
3) Oder du machst alles neu und spielst die Daten von der sicherlich vorhandenen Sicherung zurück.
Hast Du diesen Fall nicht getestet, bevor du den Server in Betrieb genommen hast?