Eben, um die Daten einfach zu kopieren brauchst doch nicht die gleichen Dateisysteme.
Ansonsten gibts für die Konvertierung 2 Möglichkeiten:
1. PartitionMagic oder ähnliche Software (schnell aber teuer)
2. Alle Daten auf eine andere Platte/Partition kopieren, die bestimmte Partition mit FAT32 formatieren und die Daten zurückkopieren (aufwendig - biliger)
convert.exe kann nur FAT32 zu NTFS konvertieren.
mfg gerhard