Servus Michael !
Der Flusi selbst muss nicht neu installiert werden, da die Einträge in der Registry harmlos sind. Bestimmte Addons allerdings müssen neu installiert werden, da ihre Daten in der Registry wichtig sind und dann ja fehlen würden.
Ich würde es so machen:
Das komplette Flusi-Verzeichnis von der einen Partition auf die andere verschieben und danach alle Addons noch mal drüberinstallieren (wobei du allerings den FS-Pfad dann händisch auswählen musst da der sonst auf Grund eines Keys in der Registry gefunden wird). Danach kannst du im Windows der "alten "Partition alle Addons und den Flusi deinstallieren.
Wenn du die Einträge in der Registry händisch nachziehen möchtest findest du sie hier:
http://www.wcm.at/vb2/showthread.php?s=&threadid=71299
Da ist es aber schon fast einfacher, den Flusi neu zu installieren...