Es betrifft im Falle LOWI eigentlich nur die "eurswafd.bgl" - die sollte wenigstens im Original-Zustand noch mit AFCAD lesbar sein.
Auch bei mir bekommen einige Flieger auf einigen Airports keine sauberen Landungen mehr hin (übrigens u.a. auch Salzburg). Ich kann mir sehr oft die "Misses" anschauen...
Jüngstes Beispiel ist EDDI nach Installation von EWPro.
Mit einer ATR im VFR-Procedere bekomme ich über Ground keine Rollanweisung zum Parken mehr...weil die AFCAD-Updates für EDDI eine Parkposition dieser Maschinengröße nicht mehr zulassen.
Meine Vermutung in Deinem Fall: Aufgrund der von diesen und anderen Packages geänderten Airport-Files (evtl. Runway-Längen modifiziert, etc.) können bestimmte Flieger nun keinen sauberen Approach mehr hinlegen und starten durch.
Andere Flieger verschwinden kurz vor dem Aufsetzen, weil sie nun auf dem Apron keinen geeigneten Parkplatz mehr definiert bekommen.
Die Lösung kann eigentlich nur wie folgt aussehen:
Mit z.B. 'TTools' oder AITM muss die traffic.bgl dekompiliert und entsprechend den inzwischen geänderten Airports neu generiert werden. Viele Flieger sind da scheinbar noch für Airports ausgelegt, die sie eben unter den aktuellen Bedingungen nicht mehr anfliegen würden - der "alte" kompilierte Flugplan sieht das aber noch vor. Daher kommt es zu diesen Problemen.
Wie gesagt, nur eine Vermutung - aber eine andere Erklärung habe ich nicht.