Da hast Du schon recht, wenn Du die Umgebungsvariablen, etc. meinst.
Aber so wie es FastCGI und mod_perl für den Apache gibt, existieren auch Perl-Lösungen für den IIS, damit er nicht für jedes Script einen komplett neuen Prozess anreissen und Perl komplett laden muss.
So z.B.
Perl for ISAP (Bei ActiveState Perl dabei)
http://webcompare.internet.com/isapiperl/
Oder PerlEx
http://aspn.activestate.com/ASPN/Downloads/PerlEx/