Sollte dein Dateisystem NTFS sein, kannst du in den Eigenschaften der Dateien unter Sicherheitseinstellungen den Zugriff einstellen, gilt auch für Ordner, bzw. Laufwerke, welche mit NTFS als Dateisystem verwendest.
ansonst könntest du mit
http://www.pgpi.org/products/pgpdisk/ z.B. (Freeware, nächsten Versionen Shareware) oder ähnlichen Programmen den Zugriff auf gewisse Ordner und Laufwerke, möglicherweise auch Dateien beschränken.