rsync eignet sich gut.
http://samba.anu.edu.au/rsync/
würde aber auch ftpbackup machen
hier das script
#!/usr/bin/perl
# FTP Server Information here
$ftps = "hostname";
$ftpu = "user";
$ftpp = "pass";
$serv = "serverkennung_egal_was";
system("/bin/tar cfp - /etc | gzip | /usr/local/bin/ftpbackup -h $ftps -u $ftpu -p $ftpp -b $serv-etc.tar.gz");
system("/bin/tar cfp - /var | gzip | /usr/local/bin/ftpbackup -h $ftps -u $ftpu -p $ftpp -b $serv-var.tar.gz");
system("/bin/tar cfp - /home | gzip | /usr/local/bin/ftpbackup -h $ftps -u $ftpu -p $ftpp -b $serv-home.tar.gz");
wobei
/etc
/var
/home
die verzeichniss sind.
Cronjob einrichten - und nach belieben starten.
Greets
Elke