Nochmals Danke!
Dein Link hat mir weitergeholfen!
Ich glaube ich habe gefunden was ich gesucht habe, nämlich die Funktion EnableWindow.
Mit EnableWindow(hWndMain, false) bekommt das Hauptfenster keine Keyboard und Mouse Messages mehr. Damit hab ich alles was ich gebraucht habe.
Tut mir leid, sollte ich mich zu ungenau ausgedrückt haben.
lg