Fat32 geht natürlich nicht. Denn mit Format kann man das Dateisystem nicht ändern. Dazu musst du mit fdisk die entsprechende Partition auf der zweiten Disk löschen und neu als Fat32 erstellen.
Vorsicht !!! Wenn du vergisst, bei Fdisk auf die zweite Festplatte zu wechseln, löscht du die Daten auf der ersten Platte und alle deine Daten sind weg !!!
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