wenn du w2k in ne erweiterte partition installierst, legt es die notwendigen dateien zum starten in der win98 partition ab. (aufpassen beim löschen
)
ne andere möglichkeit wäre ne 2. primäre partition anlegen und die win98 partition zu verstecken. boot kannst dann mit nem eigenen bootmanager erledigen (zb xfdik) und du hast 2 komplett getrennte systeme.