Das ergäbe nicht viel Sinn, denn keineswegs alle files im program-folder haben immer einen Eintrag in der registry. D.h. Du würdest viele false positive löschen.
Kurz gesagt, es ist den Aufwand nicht wert. Daten und Einstellungen sichern, saubere Neuinstallation und dann gleich Image davon machen, ist jedenfalls die empfohlene Vorgangsweise.
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