Vielleicht hilft dir das:
http://www.thunderbird-mail.de/wiki/Profile_verwalten
http://www.thunderbird-mail.de/wiki/...on_Thunderbird
Du kannst also im Thunderbird unterschiedliche Profile mit unterschiedlichen Mails einrichten.
Und diese anschließend mit je einen Link je Profil vom Desktop starten.
Wenn ich es richtig in Erinnerung habe, unterstützt Thunderbird auch eine Passwort basierende Verschlüsselung je Profil
Grüße,
Zomby