Ich hab mich neben dem Adobe Reader auch mit Foxitreader rumgespielt, leider hats da auch keine brauchbaren Ergebnisse gegeben. Hab aber jetzt nach einigem Rumspielen doch eine funktionierende Lösung gefunden und zwar über den PDF Editor.
http://www.chip.de/downloads/PDF-Editor_30688199.html
Falls jemand mal dasselbe Problem haben sollte, hier die Anleitung die ich meiner schöneren Hälfte geschrieben habe.
1.) Folien in PDF Editor öffnen
Menübutton "Farben"->Setze Farben aller Texte auf Vordergrundfarbe
Da läuft dann das ganze PDF durch und färbt den Text auf schwarz um.
2.) Menübutton "Grafiken"->Bereich auf allen Seiten löschen
Damit einfach innerhalb des Hintergrundes der entfernt werden soll einen beliebigen Bereich (ein kleines Rechteck) markieren. Danach läuft wie zuvor beim Text das gesamte Dokument durch und der Hintergrund wird entfernt.
Ka ob das bei anderen PDFs auch funktioniert, aber hier hats genau das getan was ich wollte.
