Also...
Irgendwas muss ja hin sein am Dateisystem, damit es sich merkwürdig benimmt

Daher ja testdisk, welches eine nicht zerstörende Datenrettungssoftware
ist.
Das heißt, Du schreibst damit auf eine andere Platte, was testdisk auf dieser "defekten" noch findet.
Mit der Geometrie brauchst Dich imho da gar nicht zu befassen, denn da geht es imho genau um die Fehler im NTFS-Dateisystem, derer wegen Du ja gerade testdisk zum Sichern der Platten einsetzen musst.
Hoffe, das war so verständlich, aber bitte frage ruhig weiter, wenn noch was unklar bleibt.