Virtualdub kann auch mit den MKV nicht direkt etwas anfangen.
Dazu mußt man die Daten aus dem MKV erst herausholen um sie einzeln vorliegen zu haben.
Leider ist Virtual Dub im "Original" fast komplett auf reine AVI beschränkt womit z.b. h264, x264, RM, flv, Mpeg, WMV Quellen nur mit entsprechenden plugins eingelesen werden können.
Am besten einfach mal den Inhalt mit MKVextract GUI herausholen.
Aber gleich vorweg --- eine komplette Abhandlung wie mit VirtualDub gearbeitet wird übersteigt hier den Platz und vorallem gehen wir damit bereits heftig "Off Topic".
sehr gute Anleitungen (leider auf Englisch) findet man auf
http://forums.virtualdub.org/
VirtualDub ist schon recht anspruchsvoll im Umgang dafür ist aber auch extrem viel möglich

Dauert leider bis man sich da "durchgewurschtelt" hat -- dafür aber Kostenlos
