ein Bekannter hatte vor kurzen dasselbe Problem, Windows bootete nicht von dieser Festplatte, mit einer Installation von einen baugleichen PC von mir bootete der Rechner problemlos
komisch war auch, dass die "defekte" Windowsinstallation auf einen anderen System bootete, allerdings nicht komplett, dazu war die Hardware zu unterschiedlich (Intel Chipsatz auf der einen Seite, SiS auf der anderen)
meine Problemlösung war ein Klon meiner Installation und den Key auf seinen ändern
fixmbr od. fixboot nützten ebenso nichts wie eine Reparaturinstallation
imho wird in deinem Fall eine Neuinstallation notwendig sein.
was der Fehler war, ich weiß es nicht, würde mich interessieren