Hallo Cenus,
Der Reboot könnte vom Windows Update herrühren, manche Updates von Vista verlangen zwingend einen Neustart, der auch ohne Anwesenheit vom User durchgeführt wird.
Eine der Möglichkeiten ist, das ein USB-Stick oder eine USB Festplatte angeschlossen war, manche Motherboards reagieren automatisch, entdecken beim Booten den USB-Device können vermutlich von diesem zu 99,8% nicht starten. Mittlerweile hat man den USB Device abgezogen das Bios reagiert wieder, stellt wieder auf Booten von der Festplatte und dann ist es unwillkürlich die Festplatte auf dem IDE oder SATA Port 0 (oder 1 - jedenfalls mit der niedrigsten Devicezuordnung) welche zum Starten herangezogen wird.
--> Hochinteressant bei einem Raidsystem
Zum einen eine sehr praktische Funktion wenn man von USB starten will, zum anderen eine "Schaasquastelfunktionen" wenn die Bootreihenfolge durcheinandergewürfelt wird und man wie Du 2 baugleiche Festplatten verwendet...
Grüße vom Schuhverkäufer