Ich mache sowas mit rsync.
Wenn deine Platte die du sichern willst unter Knoppix /dev/hda2 ist und die USB Platte sagen wir mal /dev/sda1 dann lautet der Befehl beim Sicherungsverzeichnis /backup auf der USB Platte:
Code:
rsync -vaxE --ignore-errors /media/hda2/ /media/sda1/backup/
Natürlich mit rootrechten.