Wenn es nur am Bottsektor liegt, dann müsstest du Windows von Diskette booten können (vorausgesetzt die boot.ini stimmt). Noch besser für den Fall der Fälle bei zerschossenem Bootsektor die Super Grub Disk, mit der man in einem solchen Fall sowohl Windows als auch Linux problemlos starten kann. Wenn das nicht geht (wie offensichtlich bei dir), dann liegt das Problem anderswo - und du hättest vermutlich auch mit dem Neuaufsetzen Probleme.
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