Ich denke irgendein Tool, um die Datenbank versionieren zu können.
Ich lege Datenbanken immer per handgeschriebenem Skript an und gebe das dann einfach in die Versionsverwaltung (SVN).
Ansonsten kannst du ein Tool wie Dezign
http://www.datanamic.com/dezign/compareeditions.html verwenden, um z.B. das Updateskript von einer Version auf die nächte zu generieren.