Wenn du die Partitionen verschüsselst bist du schon mal ziemlich sicher unterwegs. Von "Folder Lock" rate ich allerdings ab, weil gerade bei Sicherheitsanwendungen vertrauen in den Softwarehersteller (oder sonstwen) fehl am Platz ist. Damit meine ich zum Beispiel sowas:
http://www.gulli.com/news/nsa-2007-12-18/
Das bekannteste freie Verschlüsselungswerkzeug ist Truecrypt. Ich habe es selbst verwendet und kann es empfehlen. Das Prinzip dahinter ist einfach:
Solange die verschlüsselte Partition nicht gemountet ist, sind deine Daten bestens geschützt. Sobald du sie allerdings ins System einbindest bist du wieder gleich sicher wie vorher. Ist also nur sinnvoll, wenn du auf die Partitionen nur gelegentlich zugreifen musst.
http://www.truecrypt.org/
Nachtrag:
Winpooch könnte für deine Zwecke auch zu gebrauchen sein. Das Tool kann kontrollieren, welche Anwendung worauf zugreifen will (Dateien, Netzwerkverbindungen, Registry,..) und dies gegebenenfalls verhindern.
http://winpooch.free.fr/