Mit dem LWMViewer kannst Du herausfinden, welche Elemente in der Szenerie aktiv sind. Mit dem Sbuilder kannst Du Default-Elemente ändern oder löschen.
http://www.scenery.org/design_utilities_d.htm
Madeira dürfte nicht Ursache des Problems sein. Vermutlich verträgt es sich mit einer anderen Szenerie nicht. Finde raus was Du verändert hast, oder stelle Deine Scenery.cfg hier rein. An der könnte man die Ursache evtl. sehen.
Gruß
Andreas