Hallo Werner,
aus dem Bauch heraus, würde ich empfehlen, das Betriebssystem immer auf die schnellste Platte zu installieren, so wie du es vorhast.
S-ATA, P-ATA (IDE) usw. kann alles , so denn es das Board unterstützt, zusammen betrieben werden.
Viel Spaß und Erfolg beim Bauen.
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Gruß
Olaf
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