Erich, dein Beitrag ist wenig hilfreich. Es ist schön für dich, wenn bei dir alles funktioniert.
Zum Problem: Da du ja offenbar mit AFCAD2 umgehen kannst, lade doch dort mal diesen Airport und lasse das Layout auf Fehler untersuchen (Menü Tools - Fault Finder). Möglicherweise sind einige Runways nicht durchgehend korrekt benannt (hatte ich letztens bei einem anderen Airport mit den gleichen Symptomen wie bei dir). Diese Fehler werden dort angezeigt und du kannst sie korrigieren.
Mehrfache AF2-Flies sind normalerweise kein Problem für den FS. Es kommt nur die bgl-Datei zur Anwendung, die in der Szeneriebibliothek die höchste Priorität hat. Ein Umbenennen der nicht benötigten Dateien hat keinen nennenswerten Effekt (höchstens im Millisekundenbereich beim Laden der Szenerie).