Hallo Adrian,
da ist wohl was schief gelaufen! Ich vermute mal, du hast die Installations-CD vom laufenden Windows auf Lfw C gestartet. Du hättest vorher im BIOS das CD-ROM-Laufwerk als erstes Boot-Laufwerk einstellen und von Diskette starten sollen, dann hätte Dir die Installations-Diskette die Auswahl angezeigt, wo das neue Win installiert werden soll und wenn Du dann "C" ausgewählt hättest, wäre diese Partition auch automatisch zuerst formatiert worden.
Aber noch ist nichts verloren:
Lass zunächst das neue BS auf F, damit Du für alle Fälle wieder booten kannst, falls wieder etwas unvorhergesehenes passiert. Starte dann die Win-Install-CD vom CD-Laufwerk aus (vorher im BIOS als 1. Boot-Lfw einstellen). Wenn das neue BS auf "C" angelegt und eingerichtet ist, mache wie folgt weiter: Sichere alles, was Du auf "F" hast außer dem dort unerwünschten Betriebssystem auf eine andere Partition oder Festplatte, wenns nicht viel ist auch auf CD oder DVD. Lösche die Partition "F", formatiere sie und lege diese Partition wieder neu an, spiele die gesicherten Daten zurück.
Danach sollte alle so sein, wie Du es ursprünglich vorhattest.
Gruß, Günther