Weil es gerade dazupasst...
...im aktuellen c't-Magazin wurde ein Programm vorgestellt, mit dem man die Aktionen von Installationsprogrammen protokollieren kann.
Es nennt sich TrackWinstall und ist im Download-Bereich von Heise verfügbar:
http://www.heise.de/ct/ftp/
ftp://ftp.heise.de/pub/ct/ctsi/trackwinstall_1_0.zip
Ich habe es noch nicht ausprobiert aber ich nehme an, dass man es so konfigurieren kann, dass es beliebige Verzeichnisse (=FS9-Verzeichnis) prüfen kann.