Da kommt bestimmt noch eine tiefgründigere Erklärung. Aber im Prinzip ist die Priorität so angelegt, dass bei mehreren übereinander liegenden Szenerieobjekten nur die jeweils oberen Teile angezeigt werden. Man löscht z.B. keine Default-Runway beim Installieren einer Zusatzszenerie, sondern das Original wird schlicht deaktiviert, indem die Neue eine höhere Priorität bekommt.
Gerade bei korrigierter Lage des neuen Airports könnte es da sonst zu unschönen Doppelabblidungen kommen.
Kommen sich verschiedene Szenerien geografisch "nicht ins Gegege", (wie z.B. Hong Kong und Frankfurt) dann ist es egal, was weiter oben steht. Stünde Deine neue Szenerie allerdings "unterhalb" der Default, würdest Du wieder die Autogen-Objekte von MS angezeigt bekommen.
Wozu überhaupt eine Szeneriebibliothek?
Dort wird dem Flusi gesagt, wo seine Szeneriedateien stehen; sozusagen Verknüpfungen zum Programm destgelegt. Eine nicht "angemeldete" Zusatzszenerie (kommt bei Freeware ohne "Install-automatik" schon mal vor, kann der Flusi nicht finden und daher auch nicht darstellen.
Wie gesagt, dsas ist nur "Hausfrauentheorie", bessere Erklärungen folgen bestimmt noch.
