Ich könnte jetzt antworten: RTFM
Ist aber nicht so ganz meine Art. Also:
1. Terrain SDK von Microsoft runterladen und installieren. Das gibt's
HIER
2. Die Datei imagetool.exe, die dann im SDK-Ordner zu finden ist, in den Ordner ...\FS9\modules\ASV\ActiveEnvironment kopieren.
3. ASV starten
4. Active Environment anklicken.
Dort gibt es einen Button zur Umwandlung der Wolkentexturen ins DXT3-Format. Nebenbei kann man auch noch Mips aktivieren, das schont auch die Performance. Die Umwandlung dauert ein Weilchen, also keine Panik bekommen.