Hast du von deinem Ubuntu-Linux aus Schreibzugriff auf die ntfs-Partition? Für diesen Fall könnte ich mir vorstellen, dass du dir die ntfs-Partition von Linux aus "gekillt" hast (Schreibzugriff von Linux auf ntfs funktioniert noch nicht zuverlässig).
Bis du dir sicher, dass sich da bei dir kein anderes Hardwareproblem einschleicht (z.b. RAM -> ev. mal mit Memtest86+ [sollte im GRUB-Bootmenu verfügbar sein] checken)?
Ansonsten würde ich die Daten sichern (anscheinend kannst du ja noch von Linux aus darauf zugreifen) und neuinstallieren.
Gruss
DocHofa
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