Eine CD verwendet andere Mechanismen zum Booten als USB-Sticks.
Beides muss vom BIOS unterstützt werden.
Bei den Sticks gibt es auch unterschieldiche Ansätze.
Ältere Sticks machten eine Diskettenemulation, die neueren müssen wie eine HDD angesprochen werden.
Auf alle Fälle musst Du den Stick bootfähig machen.
Unter Win9x/DOS ging das früher mit SYS LW:
Wie es mit einem USB-Stick geht kann ich auch nicht sagen.
Vielleicht findest Du unter
http://www.nu2.nu/ was?!