Ja genau Patrick ... und das ist eine sehr angenehme Eigenart des FS. Es ermöglicht mir nämlich, bei Langstreckenflügen nach dem Handoff ins Bett zu hüpfen und den Flug am nächsten Morgen wieder zu übernehmen. Es kommt allerdings vor, dass die Waypoints dann erstmal abgearbeitet werden. Man wird gelegentlich von ATC auf Gegenkurs geschickt, bis alle bereits überflogenen Wegpunkte des Flugplans vom FS intern "abgehakt" wurden. Das kann schon mal ein paar Minuten dauern und war beim ersten Mal etwas verwirrend. Man sollte den "falschen" Anweisungen dann unbedingt Folge leisten, sonst wird einem wirklich der Flugplan gestrichen.
BTW: Wenn man seinen Flugplan vor dem Flug abspeichert, kann man diesen übrigens wieder laden, wenn einem der Flugplan gestrichen wurde. Dann werden auch automatisch die Wegpunkte abgearbeitet (s. o.) und es geht weiter.