Moin Herbert,
die Sache mit Auto-Pedalen ist die, dass es ja zwei Achsen sind (Gas und Bremse), während Seitenruder nur eine Achse haben, und die auch noch mit Mittelstellung.
Die Tatsache, dass es funktioniert, nur verkehrtrum, lässt allerdings darauf schließen dass das Steuern eines Seitenruder mit deinen Pedalen grundsätzlich möglich ist

(habe selber noch keine Auto-Pedale gehabt). Kann man die nicht an den Pedalen direkt umschalten auf Einachs-Betrieb?
Schau doch auch mal in die Systemeinstellungen-Game Controller, was da für Achsen und Einstellmöglichkeiten für die Pedale angezeigt wird.
Wo im Flusi hast du das Reverse eingestellt? In den Zuordnungen (Häkchen gesetzt)? Vielleicht ist deine fs9.cfg schreibgeschützt?
Falls du ein registriertes FSUIPC hast: da kann man auch noch verschiedene Einstellungen vornehmen.
Probier einfach mal rum und schreib, was du gemacht hast und was das Ergebnis war.
Gruß
Boris