Jo, wie gesagt, im FS9 ist das "normal".
Ich hab eine ATI-Graphikkarte und auch dort verhält es sich genauso, wie Yves beschreibt inkl. Verzögerung und nicht verschwindender Menüs.
Ich würde mir da wirklich keine großen Gedanken darüber machen. Einfach alles zu Beginn eines Fluges im Fenstermodus einstellen, dann auf Vollbild umschalten und fliegen.