Dein Screenshot schaut wirklich ziemlich grimmig aus.
Hast Du schon mal die Standard-Einstellungen des FS9 benutzt? Bei "hoch" sollten wesentlich bessere Bilder rauskommen. Wenn nicht, dann ist entweder bei der Installation etwas schiefgegangen oder es ist ein Treiberproblem.
Ich sehe außerdem in der Menüzeile auch die Einträge "PMDG", "IVAO" und "Modules" was auf Zusatzprogramme schließen lässt. Hast Du den FS9 nach der Installation auch ohne Zusatzprogramme ausprobiert?
Für den Betrieb im Fenstermodus würde ich einfach die entsprechende Option im Menü wählen oder Alt-Enter drücken. Die Pause beim Anwendungswechsel lässt sich in den Optionen ausschalten. (Man muss nicht immer gleich in den cfg-Dateien herumeditieren.
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