Mailserver:
http://www.workaround.org/articles/ispmail/index.shtml
FTP: Da gibt es eigentlich nur zwei Favoriten, wu-ftpd und proftpd.
Immer mehr kommt vsftp.
Webserver: Kommt darauf an was er können soll, Multihosting oder nur ein paar Projekte.
Vor allem setzen fast alle ISP auf Verwaltungsoberflächen (Confixx, Plesk, CPanel, Syscp, PD-Admin oder Eigenentwicklungen.)
Je nach Oberfläche gibt es unterschiedliche Konfigurationen.
Gute Anlaufstelle ist
www.rootforum.de
Sloter