Wie ist denn die externe Festplatte angeschlossen, USB2(eventuell über Hub) oder Firewire? Sollte die Platt an einem Hub hängen, dann versuch mal sie direkt an den PC anzuschliessen und schau, ob es dann immer noch Fehler gibt.
FAT32 dürfte aber keine Probleme verursachen.
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cya,
artur
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