Probiere SP2 installieren, bevor Du das System neu aufsetzt, sonst mußt Du Linux nochmal bzw. den GRUB oder LILO neu konfigurieren, so Du diesen Bootloader verwendest, da Windows den bei einer Neuinstallation überschreibt.
Noch ein Tip: Steck die Karte an einem anderen Steckplatz, vielleicht näher zum AGP, falls noch nicht belegt.
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