Ist die Installationspartition auch aktiv gesetzt? Nimm mal eine stinknormale Bootdiskette und schau Dir die Partitionsdaten aml an und ob da eine Partition akztiv (A) gesetzt ist!
Noftfalls versuche mal die Platte zu partitionieren auf 50 GB Teile!
Bei Fat32 gibts zb Probleme gab (gibt?) es Probleme ab gewissen Partitionsgrößen
(guckst Du hier)!