Hallo Kempfi,
in den meisten Fällen wird nichts passieren, jedoch:
es gibt einige Progis die Windows-Installer brauchen/verwenden, und wenn die dann nicht da sind geht´s nicht.
Ich hab die Installer, nach einigen negativen Erfahrungen, einfach in eine andere Partition gesichert. Ggf. kannst Du sie auch komprimieren.