Hallo!
Die leuchten bei mir auch auf.
Ich schalte die Master Caution vor dem Engine Start immer aus (auf das große gelbe Feld zw. dem Fire Warning Feld und den Display mit den Warnings klicken. Ich hab mir bei AVSIM eine Checkliste für die PMDG 737 gesaugt, da steht vor dem Engine Start "Clear Master Caution". Wenn du dann alles korrekt machst, leuchtet auch keine der Warnings mehr auf.
Das mit dem Triebwerk ist bei mir noch nie vorgekommen....
Du startest aber die Engines nicht mit STRG+E, oder

?
mfg
Martin