ist heutzutage ziemlich egal ...
sobald ein ide-controller verwendet wird, sind die benötigten ressourcen für den zweiten IMHO auch vernachlässigbar (außer du hast extrem viele geräte drinnen und benötigst ressourcen

) ...
ich würde beide jeweils einzeln als master anschließen ... wenn es dir lieber ist beide am gleichen controller anzuschließen, dann würd ich jenes laufwerk als master anschließen, dass du voraussichtlich häufiger benötigen wirst ...