Ganz einfach: Du musst eine leere Datei "FS2002.cfg" im Hauptverzeichnis Deines FS2004 anlegen. Dann erkennt ihn das FMC als FS2002 und sucht die .pln-Dateien in FS2004\Flights\MyFlts.
Vollständig FS2004-kompatibel ist das Ding nicht, aber daran können wir leider nichts ändern...
