Nein, ISA Server ist nicht standardmässig bei W2kServer dabei, man kanns aber drauf installieren.
Man kann dabei diverse Einstellungen machen (also was darf vom internen Netz raus und was darf von draussen rein)... Man kann so einiges rumkonfigurieren aufm ISA - Server aber dazu schaust dir besser folgende beiden Seiten an:
http://www.isaserver.org/
http://www.msisafaq.de/
Falls du ihn dir zulegst und Problem damit hast wirst auf den beiden Seiten sicher Lösungen dazu finden... ansonsten kannst natürlich auch hier posten.