Was sicher auch nicht verkehrt ist. :-)

3 Gründe würden mir spontan einfallen:
In /boot liegt der Kernel. Ohne Kernel bootet Linux nicht. Im Crashfall einen passenden Kernel zu haben ist daher manchmal recht praktisch.
Auf alten Systemen muss der Kernel (also /boot) unter den "magischen 1024 cylinders" liegen.
Ausserdem darf /boot z.B. nicht auf einem Software Raid-0/5 liegen (zumindest bei lilo nicht).

mit captive auf ntfs schreiben geht angeblich saulangsam, habs leider no net selbst ausprobiert

da gibsn tool, explore2fs für windows,
liest ext partitionen und kann auch dateien ins ntfs rüberexportieren:
http://uranus.it.swin.edu.au/~jn/linux/explore2fs.htm

leg dir eine partition fuer home an. das hat den vorteil dass wenn du mal dein linux radieren und eine neue distro aufsetzen willst du dein home separat hast. und damit alle settings etc sofort beim ersten start zur verfuegung hast.